Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab23P35288 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab23P35288 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab23P35288 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab23P35288 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab23P35288 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab23P35288 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab23P35288 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab23P35288 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab23P35288 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab23P35288 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab23P35288 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms