Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sftpa1P35242 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sftpa1P35242 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sftpa1P35242 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sftpa1P35242 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sftpa1P35242 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sftpa1P35242 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sftpa1P35242 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sftpa1P35242 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sftpa1P35242 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sftpa1P35242 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sftpa1P35242 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sftpa1P35242 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sftpa1P35242 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms