Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc5P32043 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms