Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms