Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms