Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms