Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms