Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VtnP29788 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VtnP29788 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VtnP29788 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VtnP29788 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VtnP29788 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VtnP29788 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VtnP29788 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VtnP29788 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VtnP29788 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VtnP29788 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VtnP29788 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VtnP29788 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VtnP29788 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VtnP29788 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VtnP29788 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VtnP29788 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VtnP29788 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VtnP29788 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VtnP29788 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VtnP29788 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VtnP29788 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VtnP29788 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
VtnP29788 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VtnP29788 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
VtnP29788 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VtnP29788 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
VtnP29788 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VtnP29788 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VtnP29788 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VtnP29788 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VtnP29788 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VtnP29788 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VtnP29788 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VtnP29788 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VtnP29788 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VtnP29788 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
VtnP29788 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VtnP29788 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VtnP29788 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VtnP29788 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VtnP29788 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
VtnP29788 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VtnP29788 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VtnP29788 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
VtnP29788 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
VtnP29788 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
VtnP29788 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VtnP29788 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VtnP29788 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VtnP29788 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VtnP29788 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VtnP29788 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VtnP29788 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
VtnP29788 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VtnP29788 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VtnP29788 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VtnP29788 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VtnP29788 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VtnP29788 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VtnP29788 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VtnP29788 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VtnP29788 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VtnP29788 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VtnP29788 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VtnP29788 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VtnP29788 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VtnP29788 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
VtnP29788 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VtnP29788 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VtnP29788 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VtnP29788 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VtnP29788 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VtnP29788 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VtnP29788 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VtnP29788 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VtnP29788 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VtnP29788 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VtnP29788 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VtnP29788 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VtnP29788 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VtnP29788 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VtnP29788 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VtnP29788 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VtnP29788 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VtnP29788 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VtnP29788 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
VtnP29788 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VtnP29788 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VtnP29788 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VtnP29788 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VtnP29788 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VtnP29788 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VtnP29788 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VtnP29788 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VtnP29788 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VtnP29788 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VtnP29788 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VtnP29788 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VtnP29788 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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