Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprmP28828 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprmP28828 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprmP28828 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprmP28828 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprmP28828 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprmP28828 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprmP28828 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprmP28828 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprmP28828 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprmP28828 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprmP28828 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms