Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Marcksl1P28667 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms