Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col2a1P28481 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col2a1P28481 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms