Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd9P28357 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms