Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms