Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChgaP26339 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChgaP26339 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChgaP26339 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.83
ChgaP26339 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChgaP26339 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms