Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd247P24161 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd247P24161 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd247P24161 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd247P24161 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd247P24161 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd247P24161 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd247P24161 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd247P24161 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms