Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms