Protein–RNA interactions for Protein: P23738

Hdc, Histidine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdcP23738 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HdcP23738 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HdcP23738 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HdcP23738 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HdcP23738 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HdcP23738 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HdcP23738 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HdcP23738 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HdcP23738 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HdcP23738 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HdcP23738 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HdcP23738 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HdcP23738 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HdcP23738 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HdcP23738 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HdcP23738 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HdcP23738 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HdcP23738 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HdcP23738 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HdcP23738 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HdcP23738 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HdcP23738 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HdcP23738 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HdcP23738 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HdcP23738 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HdcP23738 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HdcP23738 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HdcP23738 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HdcP23738 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HdcP23738 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HdcP23738 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HdcP23738 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HdcP23738 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HdcP23738 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HdcP23738 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HdcP23738 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HdcP23738 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HdcP23738 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HdcP23738 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HdcP23738 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HdcP23738 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HdcP23738 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HdcP23738 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HdcP23738 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HdcP23738 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HdcP23738 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HdcP23738 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HdcP23738 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HdcP23738 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HdcP23738 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HdcP23738 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HdcP23738 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HdcP23738 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HdcP23738 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HdcP23738 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HdcP23738 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HdcP23738 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HdcP23738 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HdcP23738 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HdcP23738 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HdcP23738 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HdcP23738 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HdcP23738 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HdcP23738 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HdcP23738 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HdcP23738 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HdcP23738 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HdcP23738 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HdcP23738 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HdcP23738 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HdcP23738 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HdcP23738 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HdcP23738 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HdcP23738 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HdcP23738 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HdcP23738 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HdcP23738 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HdcP23738 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HdcP23738 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HdcP23738 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HdcP23738 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HdcP23738 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HdcP23738 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HdcP23738 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HdcP23738 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HdcP23738 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HdcP23738 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HdcP23738 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HdcP23738 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HdcP23738 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HdcP23738 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HdcP23738 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HdcP23738 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HdcP23738 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HdcP23738 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HdcP23738 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HdcP23738 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HdcP23738 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HdcP23738 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HdcP23738 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms