Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tsta3P23591 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsta3P23591 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms