Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd8P23463 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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