Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkchP23298 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms