Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms