Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RarbP22605 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RarbP22605 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RarbP22605 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RarbP22605 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RarbP22605 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RarbP22605 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RarbP22605 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RarbP22605 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RarbP22605 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RarbP22605 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RarbP22605 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RarbP22605 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RarbP22605 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RarbP22605 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RarbP22605 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RarbP22605 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RarbP22605 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RarbP22605 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RarbP22605 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RarbP22605 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RarbP22605 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RarbP22605 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RarbP22605 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RarbP22605 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RarbP22605 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RarbP22605 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RarbP22605 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RarbP22605 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RarbP22605 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RarbP22605 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RarbP22605 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RarbP22605 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RarbP22605 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RarbP22605 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RarbP22605 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RarbP22605 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RarbP22605 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RarbP22605 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RarbP22605 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RarbP22605 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RarbP22605 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RarbP22605 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RarbP22605 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RarbP22605 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RarbP22605 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RarbP22605 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RarbP22605 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RarbP22605 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RarbP22605 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RarbP22605 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RarbP22605 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RarbP22605 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RarbP22605 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RarbP22605 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RarbP22605 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RarbP22605 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RarbP22605 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RarbP22605 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RarbP22605 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RarbP22605 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RarbP22605 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RarbP22605 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RarbP22605 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RarbP22605 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RarbP22605 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RarbP22605 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RarbP22605 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RarbP22605 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RarbP22605 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RarbP22605 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RarbP22605 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RarbP22605 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RarbP22605 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RarbP22605 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RarbP22605 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RarbP22605 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RarbP22605 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RarbP22605 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RarbP22605 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RarbP22605 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RarbP22605 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RarbP22605 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RarbP22605 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RarbP22605 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RarbP22605 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RarbP22605 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RarbP22605 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RarbP22605 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RarbP22605 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RarbP22605 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RarbP22605 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RarbP22605 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RarbP22605 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RarbP22605 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RarbP22605 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RarbP22605 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RarbP22605 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RarbP22605 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RarbP22605 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms