Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk1P22518 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk1P22518 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk1P22518 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk1P22518 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk1P22518 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk1P22518 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk1P22518 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk1P22518 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk1P22518 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk1P22518 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk1P22518 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk1P22518 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk1P22518 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms