Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Klra1P20937 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Klra1P20937 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klra1P20937 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klra1P20937 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klra1P20937 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klra1P20937 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms