Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc2P20801 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms