Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms