Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms