Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsdP18242 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsdP18242 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsdP18242 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsdP18242 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsdP18242 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsdP18242 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsdP18242 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsdP18242 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtsdP18242 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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