Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PcnaP17918 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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PcnaP17918 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcnaP17918 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcnaP17918 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcnaP17918 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms