Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms