Protein–RNA interactions for Protein: P16092

Fgfr1, Fibroblast growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1P16092 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr1P16092 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Fgfr1P16092 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Fgfr1P16092 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fgfr1P16092 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fgfr1P16092 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fgfr1P16092 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fgfr1P16092 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fgfr1P16092 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Fgfr1P16092 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fgfr1P16092 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Fgfr1P16092 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fgfr1P16092 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fgfr1P16092 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fgfr1P16092 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fgfr1P16092 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fgfr1P16092 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fgfr1P16092 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms