Protein–RNA interactions for Protein: P15388

Kcnc1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnc1P15388 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms