Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd44P15379 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd44P15379 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd44P15379 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd44P15379 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cd44P15379 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd44P15379 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd44P15379 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd44P15379 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd44P15379 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd44P15379 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd44P15379 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms