Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lmnb1P14733 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lmnb1P14733 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lmnb1P14733 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lmnb1P14733 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lmnb1P14733 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lmnb1P14733 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lmnb1P14733 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lmnb1P14733 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lmnb1P14733 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lmnb1P14733 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lmnb1P14733 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Lmnb1P14733 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Lmnb1P14733 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lmnb1P14733 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lmnb1P14733 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lmnb1P14733 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lmnb1P14733 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lmnb1P14733 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lmnb1P14733 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lmnb1P14733 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lmnb1P14733 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lmnb1P14733 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lmnb1P14733 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lmnb1P14733 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lmnb1P14733 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lmnb1P14733 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lmnb1P14733 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lmnb1P14733 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lmnb1P14733 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms