Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms