Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb1P13372 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms