Protein–RNA interactions for Protein: P12032

Timp1, Metalloproteinase inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp1P12032 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp1P12032 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp1P12032 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp1P12032 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp1P12032 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp1P12032 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp1P12032 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp1P12032 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp1P12032 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp1P12032 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp1P12032 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp1P12032 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp1P12032 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp1P12032 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp1P12032 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp1P12032 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp1P12032 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp1P12032 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp1P12032 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp1P12032 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp1P12032 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp1P12032 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp1P12032 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp1P12032 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp1P12032 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp1P12032 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp1P12032 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Timp1P12032 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timp1P12032 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timp1P12032 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timp1P12032 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timp1P12032 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timp1P12032 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timp1P12032 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timp1P12032 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Timp1P12032 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Timp1P12032 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timp1P12032 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Timp1P12032 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms