Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DmdP11531 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DmdP11531 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DmdP11531 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DmdP11531 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DmdP11531 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DmdP11531 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DmdP11531 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DmdP11531 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DmdP11531 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DmdP11531 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DmdP11531 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DmdP11531 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DmdP11531 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DmdP11531 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DmdP11531 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DmdP11531 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DmdP11531 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DmdP11531 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DmdP11531 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DmdP11531 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DmdP11531 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DmdP11531 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DmdP11531 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DmdP11531 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DmdP11531 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DmdP11531 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DmdP11531 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DmdP11531 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DmdP11531 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DmdP11531 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DmdP11531 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DmdP11531 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DmdP11531 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DmdP11531 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DmdP11531 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DmdP11531 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DmdP11531 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DmdP11531 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DmdP11531 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DmdP11531 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DmdP11531 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DmdP11531 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DmdP11531 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DmdP11531 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DmdP11531 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DmdP11531 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DmdP11531 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DmdP11531 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DmdP11531 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DmdP11531 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DmdP11531 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DmdP11531 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DmdP11531 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DmdP11531 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DmdP11531 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DmdP11531 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DmdP11531 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DmdP11531 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DmdP11531 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DmdP11531 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DmdP11531 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DmdP11531 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DmdP11531 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DmdP11531 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DmdP11531 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DmdP11531 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DmdP11531 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DmdP11531 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DmdP11531 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DmdP11531 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DmdP11531 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DmdP11531 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DmdP11531 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DmdP11531 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DmdP11531 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DmdP11531 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DmdP11531 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DmdP11531 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DmdP11531 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DmdP11531 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DmdP11531 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DmdP11531 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DmdP11531 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DmdP11531 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DmdP11531 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DmdP11531 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DmdP11531 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DmdP11531 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DmdP11531 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DmdP11531 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DmdP11531 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DmdP11531 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DmdP11531 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DmdP11531 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DmdP11531 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DmdP11531 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DmdP11531 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DmdP11531 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DmdP11531 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms