Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PolP11369 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PolP11369 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolP11369 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolP11369 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolP11369 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PolP11369 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolP11369 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolP11369 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolP11369 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolP11369 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolP11369 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolP11369 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PolP11369 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolP11369 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolP11369 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolP11369 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolP11369 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PolP11369 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolP11369 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolP11369 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolP11369 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolP11369 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolP11369 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolP11369 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolP11369 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolP11369 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolP11369 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolP11369 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolP11369 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolP11369 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolP11369 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolP11369 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolP11369 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolP11369 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolP11369 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolP11369 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolP11369 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolP11369 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolP11369 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolP11369 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolP11369 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolP11369 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolP11369 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolP11369 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolP11369 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolP11369 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolP11369 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolP11369 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PolP11369 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolP11369 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolP11369 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolP11369 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PolP11369 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolP11369 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PolP11369 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolP11369 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolP11369 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolP11369 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolP11369 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolP11369 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolP11369 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolP11369 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolP11369 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolP11369 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolP11369 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PolP11369 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolP11369 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolP11369 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolP11369 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolP11369 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolP11369 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolP11369 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolP11369 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolP11369 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolP11369 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolP11369 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolP11369 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolP11369 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolP11369 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolP11369 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolP11369 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolP11369 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolP11369 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolP11369 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolP11369 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolP11369 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PolP11369 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
PolP11369 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PolP11369 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PolP11369 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PolP11369 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolP11369 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolP11369 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolP11369 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolP11369 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolP11369 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolP11369 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolP11369 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolP11369 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms