Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spp1P10923 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spp1P10923 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spp1P10923 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spp1P10923 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spp1P10923 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spp1P10923 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms