Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd4P10628 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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