Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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