Protein–RNA interactions for Protein: P10078

Zfp28, Zinc finger protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp28P10078 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp28P10078 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zfp28P10078 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp28P10078 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zfp28P10078 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp28P10078 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp28P10078 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp28P10078 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp28P10078 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp28P10078 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp28P10078 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp28P10078 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp28P10078 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp28P10078 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp28P10078 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp28P10078 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp28P10078 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp28P10078 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp28P10078 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zfp28P10078 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp28P10078 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp28P10078 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp28P10078 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp28P10078 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp28P10078 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp28P10078 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp28P10078 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp28P10078 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zfp28P10078 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zfp28P10078 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp28P10078 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp28P10078 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp28P10078 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp28P10078 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp28P10078 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp28P10078 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp28P10078 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp28P10078 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp28P10078 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp28P10078 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp28P10078 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp28P10078 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp28P10078 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp28P10078 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp28P10078 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp28P10078 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp28P10078 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp28P10078 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp28P10078 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp28P10078 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp28P10078 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp28P10078 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp28P10078 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp28P10078 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp28P10078 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp28P10078 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp28P10078 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp28P10078 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp28P10078 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp28P10078 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp28P10078 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp28P10078 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp28P10078 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp28P10078 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp28P10078 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms