Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Schip1P0DPB4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms