Protein–RNA interactions for Protein: P0C5K0

Sbk3, Uncharacterized serine/threonine-protein kinase SBK3, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbk3P0C5K0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sbk3P0C5K0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sbk3P0C5K0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sbk3P0C5K0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sbk3P0C5K0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sbk3P0C5K0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sbk3P0C5K0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sbk3P0C5K0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sbk3P0C5K0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sbk3P0C5K0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sbk3P0C5K0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sbk3P0C5K0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sbk3P0C5K0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sbk3P0C5K0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sbk3P0C5K0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sbk3P0C5K0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sbk3P0C5K0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sbk3P0C5K0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sbk3P0C5K0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sbk3P0C5K0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sbk3P0C5K0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sbk3P0C5K0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sbk3P0C5K0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sbk3P0C5K0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms