Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Surf1P09925 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf1P09925 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf1P09925 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf1P09925 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf1P09925 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms