Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms