Protein–RNA interactions for Protein: P08882

Gzmc, Granzyme C, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmcP08882 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmcP08882 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmcP08882 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmcP08882 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmcP08882 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmcP08882 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmcP08882 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmcP08882 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmcP08882 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmcP08882 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmcP08882 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GzmcP08882 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GzmcP08882 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GzmcP08882 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmcP08882 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmcP08882 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GzmcP08882 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms