Protein–RNA interactions for Protein: P08042

Zfp1, Zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp1P08042 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp1P08042 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp1P08042 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms