Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcP06800 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprcP06800 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprcP06800 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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PtprcP06800 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprcP06800 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprcP06800 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprcP06800 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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PtprcP06800 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprcP06800 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprcP06800 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprcP06800 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcP06800 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms